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计算机辅助药物设计(CADD)临床应用培训班
发布时间:2022/7/21 11:27:30 作者:互联网 阅读量:179

各企事业单位、高等院校及科研院所:

  计算机辅助药物设计(Computer Aided Drug DesignCADD)主要是以计算机为工具,可以从大数据层面对中医药“多点显效、协同增效”的作用机制进行研究,是解释中医药原理的新方法,有助于阐明中药起效的精准的分子机制和药效成分。根据配体-受体相互作用的原理,通过各种理论计算方法以及分子构象模拟技术,再根据数据库中收录的大量活性化合物构效关系的数据,预测出具有药效的先导化合物。在研究传统中药的过程中,CADD 是优化开发新中药处方以及发现先导化合物的重要手段。运用反向分子对接相似度搜索,可快速预测出中药有效成分的作用靶点,有助于科学合理地解释传统中药的作用机制。运用CADD 不仅可以减少药物靶点筛选的盲目性,节约研发时间,加快研究进程,还可节约研究成本。它是设计和优化先导化合物的方法,特别是在食品、生物、化学、医药方面应用广泛。

  由于国内药物研究发展缓慢,学习平台文献资料较少,培训学习迫在眉睫,应广大科研人员要求。

  职业教育研究所(http://www.camec.org.cn )工业与信息化技术培训网(http://www.itcc.ac.cn )特举办“计算机辅助药物设计(CADD)临床应用培训班”。本次培训旨在运用不同的专业软件对知识进行由浅入深,层层递进分阶段系统讲解,配合案例边讲边练, 让学员能运用专业软件针对每个技术点进行上机操作。

  一、培训目标:

  1,掌握包括 PDB 数据库检索、分子对接、虚拟筛选、蛋白结构分析等基本原理和使用方法。

  2,掌握Discovery StudioPymolAutodock 等软件的操作技能。

  3,从药物临床试验的不同角度,结合临床试验实践、管理、核查中的经验做好临床科研。

  4,为临床医生强化临床医务人员临床研究的GCP意识。

  二、主讲专家:

  清华大学、上海交通大学、中国科学院等高校医学生物信息学学科带头人、擅长医学实验设计、网络药理学、生物信息学、计算机辅助药物设计等。发表数十篇专业领域内学术论文及SCI论文,主编或参与编写多部著作。主持或参与国家自然科学基金、省自然科学基金、中医药管理局基金、卫生计生委基金多项。参与多家三甲医院临床项目研究合作,科研及授课经验很丰富。

  三、培训时间:    

  2022年08月19日— 2022年08月22日   远程在线培训

  (第一天数据及操作软件调试,共授课三天)

  四、参加对象:

  全国各临床三甲医院神经内科、骨科、眼科、肾内科、呼吸科、心内科、皮肤科、麻醉科、精神心理科、妇科、产科、普外科、肿瘤科等临床科研医生。

  全国各高校、科研院所、企业从事生命科学、蛋白质、药物设计、生物医学等研究的科研人员以及 CADD 爱好者。

  五、课程大纲

  1、药物设计的原理和方法

  本部分重点介绍药物设计的基本原理,基于受体和配体的药物设计方法

  2、生物分子互作基础

  本部分重点介绍生物分子互作以及分子对接的基础概述

  3、蛋白质结构数据库(PDB)的使用方法

  上机操作PDB数据库的检索、靶点蛋白的三维结构分析和活性位点预测

  4、小分子化合物库

  本部分重点介绍小分子化合物库,上机操作各数据库的使用

  5、同源模建法预测蛋白质结构

  上机操作Discovery Studio软件同源模建

  6、蛋白结构分析

  本部分重点介绍Pymol 软件使用,上机操作Pymol 软件蛋白小分子相互作用、蛋白蛋白相互作用

  7、小分子构建

  8、分子对接

  上机操作利用Autodock软件进行分子对接的过程、方法、结果评价。并上机操作DOCK软件进行分子对接

  9、虚拟筛选

  上机操作基于Autodock结果进行虚拟筛选

  10、ADME 预测

  11、三维定量构效关系(3DQSAR

  上机操作CoMFA模型和CoMSIA模型的构建

  12、总结及答疑

  六、实例知识点:

  1、 晶体结构        2、小分子

  3.药效团模型        4.相互作用

  5.3D 结构         6.氢键

  7. 3D view         8. 小分子 2D 结构

  9、3D mol         10、Discovery Studio

  11.分子对接 1      12.分子对接11

  13.虚拟筛选

  七、联系方式:

  联系人期 涛(老师)            手机(微信同号):15210196261

  电话:010-56129268                官方咨询QQ:513692711

  E_mail:cashq_ict@vip.163.com     网址: http://www.camec.org.cn

  工业与信息化技术培训网:http://www.itcc.ac.cn

  医学生物信息学QQ群号:876726523(加群备注:期涛邀请)


                                       职业教育研究所

                                        2022年7月21日