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肠道菌群分析R语言实践临床应用培训班
发布时间:2022/9/28 10:29:51 作者:互联网 阅读量:223

各企事业单位、高等院校及科研院所:
   肠道菌群相关研究是目前非常火热的方向,同时也是国家自然科学基金资助的重点方向之一,其适用的研究领域也迅速扩展,从经典的中医、中药领域,到代谢性疾病、神经系统疾病、心脑血管疾病和免疫相关疾病。然而,在研究中面对的最大痛点是测序的文章发表后,后续的机制研究该怎么延伸,这一直是肠道菌群相关研究的重要难点。
   鉴于肠道菌群与临床疾病的广泛影响及重要作用,然而在具体的研究过程中,哪些疾病可以设计与肠道菌群的相关研究?肠道菌群研究的实验方向都有哪些?具体试验分组该如何设置?样本如何收集和处理?可以和哪些研究手段进行结合分析?如何实现“短、平、快”的发表文章,积攒研究基础?
   由于国内关于肠道菌群研究发展缓慢,学习平台文献资料较少,培训学习迫在眉睫,应广大科研人员要求,职业教育研究所(http://www.camec.org.cn)工业与信息化技术培训网(http://www.itcc.ac.cn)特举办“肠道菌群分析R语言实践临床应用培训班”。本次培训旨在运用不同的专业软件对知识进行由浅入深,层层递进分阶段系统讲解,配合案例边讲边练,让学员能运用专业软件针对每个技术点进行上机操作。
   一、培训目标:
   1.掌握肠道菌群研究课题研究思路与设计方法;
   2.掌握宏基因组测序分析数据分析与制图方法;
   3.掌握16S测序分析数据分析与制图方法;
   4.掌握代谢组学分析数据分析与制图方法;
   5.掌握R语言、SIMCA软件应、Fastqc软件、Mothur软件及galaxy数据库应用;
   6.掌握肠道菌群文章写作与投稿。
   二、主讲专家:
   来自清华大学、上海交通大学、中国科学院等高校医学生物信息学学科带头人、擅长医学实验设计、网络药理学、生物信息学、计算机辅助药物设计、肠道菌群分析等。发表数十篇专业领域内学术论文及SCI论文;主编或参与编写多部著作,主持或参与国家自然科学基金、省自然科学基金、中医药管理局基金、卫生计生委基金多项;参与多家三甲医院临床生物信息学的研究合作,科研及授课经验很丰富。

   三、培训时间:    

   2022年10月21日— 2022年10月24日   远程在线培训

   (第一天数据及操作软件调试,共授课三天) 
   四、参加对象:
   各省市、自治区从事临床医学、基础医学、生物医学工程等科室主任医师、副主任医师、住院医师等临床科研工作者相关人员;国内各重点大学、科研院所相关研究领域的博士、硕士相关研究生和学者等:
   五、课程大纲
   1.肠道菌群研究的意义
   重点介绍有关于肠道菌群研究在临床的治疗前景以及注意事项
   2.肠道菌群组成变化的研究方法
   重点介绍宏基因组测序分析、16S测序分析、高通量测序分析及代谢组学分析的原理、意义、结果、结果解读。实例分享讲解每一个分析在肠道菌群研究中的重要意义
   3.R语言基础
   简要介绍基于R语言的分析绘图,为相关分析实操打下坚实的基础
   4.肠道菌群常用软件及数据库
   重点介绍除R语言的分析绘图外的绘图软件及在线绘图数据库
   5.肠道菌群相关分析实操
   上机实操基于R语言、软件和数据库的分析操作
   6.肠道菌群文章写作与投稿
   重点讲述注意事项及通用格式,掌握此部分内容,一投即中
   7.总结及答疑
   针对学员在学习中存在的普遍问题进行补讲及答疑
   六、案例知识点实例讲解: 
   1.韦恩图                    
   2.物种相对丰度柱形图        
   3.聚类分析热图    
   4.OPLS-DA分析                             
   5. 差异代谢物分析
   6. LEfSe 分析                
   7. 相关性分析               
   8.α 多样性分析
   9. PCoA 分析                               
   10.KEGG分析  
   11.PCA分析1                               
   12.PCA分析2
   13.物种差异分析              
   14.累积曲线                 
   15.相对丰度分析
   七、联系方式:
   联系人:  期 涛(老师)      手机(微信同号):15210196261
   电话:010-56129268         官方咨询QQ:513692711
   E_mail:cashq_ict@vip.163.com  网址: http://www.camec.org.cn 
   工业与信息化技术培训网:http://www.itcc.ac.cn 

   医学人工智能QQ群号:876726523(加群备注:期涛邀请)


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